La série met en scène les aventures loufoques de Bob, une éponge qui vit dans un ananas au fond de la mer dans la ville de Bikini Bottom peuplée principalement de poissons. Bob travaille comme cuisinier au Crabe croustillant, un restaurant dirigé par un crabe, le Capitaine Krabs, et dont la spécialité est le pâté de crabe,un hamburger au crabe.Le meilleur ami de Bob est Patrick, une étoile de mer encore plus stupide et immature que Bob. Carlo est un calmar qui est le collègue de travail et le voisin grincheux de cette fameuse éponge, fatigué de devoir supporter ses excentricités. Bob a aussi une amie appelée Sandy, un écureuil femelle qui a décidé de vivre dans la mer.Bob l'éponge est rapidement devenue une des séries animées les plus populaires, avec des sondages qui soulignent qu'un tiers du public est constitué d'adultes, alors qu'elle a été initialement conçue pour un public enfantin.Au travers du comportement et des réactions face à la société de Bob et de Patrick, cette série est une véritable caricature du monde d'aujourd'hui (et en particulier de la société américaine).
